Enfeksiyon Paneli
Helicobacter pylori klaritromisin direnç saptama Rt-PCR kit
Katalog No: DiaRD-HPykl
Kanallar: FAM / HEX
Nakliye/Depolama Sıcaklığı: -20
DiaRD-Hpkla H. pylori Rt-PCR kiti, H. pylori infeksiyonu olan hastaların mide ve duodenal biyopsi materyali veya gaita örneklerinden H. pylori DNA’sını ve bakterideki klaritromisin direncinden sorumlu mutasyonları tespit edebilmek için gerekli tüm bileşenleri bulunduran kalitatif gerçek zamanlı bir polimeraz zincir reaksiyonu (Rt-PCR) testidir.
Kit içerisinde 16S rRNA geni içerisindeki H. pylori için spesifik bölgenin amplifikasyonunu sağlayan primerler ve çoğalmayı saptayacak florofor boya ve baskılayıcı ile işaretli TaqMan prob bulunmaktadır. Ayrıca 23S ribozomal RNA bölgesinde klaritromisin direncinden sorumlu mutasyonları araştırmaya yönelik moleküler beacon prob ve primerleri bulunmaktadır. Örnekte H. pylori spesifik DNA bulunması halinde uygulanmakta olan amplifikasyon programı süresince ileri (forward) ve geri (reverse) primerler ile hedef bölge çoğaltılmaktadır. Amplifikasyon aşamasında DNA polimeraz enziminin probu 5’ uçlarından kesmesiyle bu uca bağlanmış olan floresan boya probun 3’ucundaki baskılayıcıdan kurtularak floresan vermektedir. Oluşan floresan sinyalleri amplifikasyon süresince toplanmakta ve amplifikasyon grafikleri halinde rapor edilmektedir. Moleküler beacon prob wilde tip spesifik olarak tasarlanmış olduğundan duyarlı olan suşta bu prob için kullanılan boya kanalından sinyal alınırken, mutasyon olan (dirençli ) suşta sinyal alınmamaktadır
Kit kapsamında, olası PCR inhibitörlerin tespitini sağlamak için beta-aktin genini hedef alan primerler ve prob bulunmaktadır.
Pozitif kontrol olarak H. pylori DNA yükü 1x102 kopya/L olan örnek, negatif kontrol olarak steril PCR grade su bulunmaktadır.